Head Buster è un gioco futuro sui robot. In un campo dall'alto verso il basso, con scrolling orizzontale, robot armati sono mossi in una maniera simile ai giochi strategici della serie Super Robot Taisens.
Ogni gioco inizia dal negozio, dove i robot della vostra squadra sono portati per essere assemblati ed equipaggiati secondo le vostre preferenze. Fatto questo, nell'arena inizia il match tra scuadra rossa e squadra blu. L'obiettivo non è semplicemente distruggere i robot avversari, ma distruggere la loro base. Ogni turno si divide in fase di movimento e fase di combattimento.
I robot sono modificabili e personalizzabili, con armature e armi a proprio scelta ed abilità aggiunive, come schivare, pararsi e guarirsi.