Custom Robo prende posto nello stile tutto Nintendo di colleziona e combatti simile alla serie Pokemon, ma con robot confinate in arene 3D.
Nella modalità storia, giocherete un ragazzo che ha appena sognato sui robot. Quando si sveglia, riceve dai suoi genitori il primo robot personalizzabile, e da qui inizia l'avventura.
L'obiettivo è migliorare le tue abilità e collezionare differenti parti di robot con i quali personalizzare il proprio.
L'obiettivo principale è finire la storia collezionando ogni parte dei Robot, vincendo le battaglie e avanzando nella storia.
Vi sono due visuali in battaglia, Normale e Retro.
