Alien Legacy è un gioco di strategia e avventura nel quale ci ritroveremo ad affrontare una razza aliena ostile.
E' l'anno 2119 e ormai la Terra e piegata dalle continue lotte e disastri ambientali, viene scelta una squadra per cercare di colonizzare i pianeti vicini, viene lanciata la nave spaziale Calypso, di cui se ne perdono le tracce.
Dopo quindici anni viene mandata una nuova astronave Tauntalus incerca di superstiti e sempre con l'intento di trovarenuova accoglienza su altri pianeti per gli esseri umani e cominciare così una colonizzazione.
Noi saremo il capitano della prima Calypso e dovremo cercare di trovare un pianeta abitale dove costruire un insediamento nell'attesa dell'arrivo di Tauntalus, ma oltre a vari problemi legati all'abitabilità del nuovo pianeta dovremo affrontare anche una ostile razza aliena...