Anche Atelier Shallie: Alchemists of the Dusk Sea viene sottoposto all'operazione "Plus" da parte di Koei Tecmo.
Atelier Shallie Plus: Alchemists of the Dusk Sea arriverà dunque su PlayStation Vita, per la precisione il 3 marzo 2016 in Giappone. La nuova versione ripropone storia e contenuti dell'originale ma con alcune aggiunte, come i personaggi di Escha e Logy, nuovi scenari con ulteriori frammenti di storia, nuovi eventi che approfondiscono alcune parti meno spiegate della trama e tutti i DLC usciti per l'edizione originale.